Protein–RNA interactions for Protein: Q15629

TRAM1, Translocating chain-associated membrane protein 1, humanhuman

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAM1Q15629 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 DMRT1-201ENST00000382276 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 UBTF-213ENST00000533177 3011 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
TRAM1Q15629 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.77■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
TRAM1Q15629 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
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