Protein–RNA interactions for Protein: Q15428

SF3A2, Splicing factor 3A subunit 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3A2Q15428 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SF3A2Q15428 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 NT5C-201ENST00000245552 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 AC091138.1-202ENST00000578967 457 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 GNAL-201ENST00000269162 1722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 RABEP2-203ENST00000544477 1645 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
SF3A2Q15428 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SF3A2Q15428 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.5 ms