Protein–RNA interactions for Protein: Q15393

SF3B3, Splicing factor 3B subunit 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B3Q15393 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
SF3B3Q15393 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 TMEM61-201ENST00000371268 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 CT47B1-201ENST00000371311 1328 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 PYCARD-AS1-201ENST00000561916 1095 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 ECEL1-202ENST00000409941 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
SF3B3Q15393 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
SF3B3Q15393 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms