Protein–RNA interactions for Protein: Q15118

PDK1, [Pyruvate dehydrogenase (acetyl-transferring)] kinase isozyme 1, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 436 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDK1Q15118 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 NKIRAS2-209ENST00000479407 992 ntTSL 3 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 CENPX-202ENST00000392359 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PDK1Q15118 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
PDK1Q15118 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC23.03■■□□□ 1.28
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