Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 GUSB-201ENST00000304895 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 SMG7-AS1-201ENST00000421703 2220 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 PIP5KL1-202ENST00000388747 2198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 SLC35A3-204ENST00000427993 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 ANKHD1-221ENST00000616482 2064 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 WWC2-AS2-201ENST00000578387 2183 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC22.14■■□□□ 1.14
PCLAFQ15004 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 SPHK1-201ENST00000323374 2138 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 GUCD1-207ENST00000447813 895 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PCLAFQ15004 POU4F1-201ENST00000377208 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
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