Protein–RNA interactions for Protein: Q149N8

SHPRH, E3 ubiquitin-protein ligase SHPRH, humanhuman

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Length 1,683 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SHPRHQ149N8 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 RRAS2-201ENST00000256196 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.41■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC31.4■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC31.4■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC31.39■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC31.39■■■□□ 2.62
SHPRHQ149N8 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC31.39■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.39■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 AL355802.2-201ENST00000402069 882 ntBASIC31.38■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.38■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 PTH1R-206ENST00000430002 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 FITM1-201ENST00000267426 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 SLC25A29-212ENST00000555927 960 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC31.37■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 HSD17B14-201ENST00000263278 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 ARL6IP4-204ENST00000392435 1339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.36■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC31.35■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 DCTPP1-205ENST00000568973 878 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 TIMM50-201ENST00000314349 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.35■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC31.34■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC31.33■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.33■■■□□ 2.61
SHPRHQ149N8 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC31.32■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC31.32■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.31■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
SHPRHQ149N8 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC31.3■■■□□ 2.6
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