Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 JMJD8-201ENST00000412368 2038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 SEPT2-205ENST00000401990 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 SSSCA1-AS1-201ENST00000567594 614 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
TRIM25Q14258 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM25Q14258 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM25Q14258 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM25Q14258 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM25Q14258 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM25Q14258 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
TRIM25Q14258 GADD45A-202ENST00000370986 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 STIM2-204ENST00000467087 5154 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.32■■□□□ 1
TRIM25Q14258 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM25Q14258 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM25Q14258 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM25Q14258 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM25Q14258 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM25Q14258 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM25Q14258 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM25Q14258 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM25Q14258 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM25Q14258 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC21.31■■□□□ 1
TRIM25Q14258 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
TRIM25Q14258 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM25Q14258 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM25Q14258 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM25Q14258 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM25Q14258 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM25Q14258 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM25Q14258 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM25Q14258 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM25Q14258 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM25Q14258 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM25Q14258 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM25Q14258 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM25Q14258 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM25Q14258 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM25Q14258 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
TRIM25Q14258 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
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