Protein–RNA interactions for Protein: Q14028

CNGB1, Cyclic nucleotide-gated cation channel beta-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNGB1Q14028 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC31■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC30.99■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.99■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC30.98■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC30.98■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.98■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.97■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 HMGA2-206ENST00000536545 1788 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.97■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.96■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC30.96■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC30.95■■■□□ 2.55
CNGB1Q14028 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.95■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.94■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 RASSF1-AS1-201ENST00000629828 790 ntBASIC30.94■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 LYRM1-201ENST00000219168 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC30.94■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC30.93■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.93■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.92■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC30.92■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC30.91■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.91■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.9■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 HOMER3-203ENST00000433218 1418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC30.9■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC30.89■■■□□ 2.54
CNGB1Q14028 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 TRAF7-203ENST00000565383 799 ntTSL 5 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC30.88■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.88■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC30.88■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC30.87■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC30.86■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
CNGB1Q14028 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC30.86■■■□□ 2.53
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