Protein–RNA interactions for Protein: Q13956

PDE6H, Retinal cone rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

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Length 83 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6HQ13956 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
PDE6HQ13956 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 WDR86-201ENST00000334493 2023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PDE6HQ13956 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PDE6HQ13956 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PDE6HQ13956 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 MCMBP-202ENST00000369077 2465 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
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PDE6HQ13956 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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PDE6HQ13956 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
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PDE6HQ13956 P4HA3-202ENST00000427714 2248 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 TERT-206ENST00000508104 2486 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
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PDE6HQ13956 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
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PDE6HQ13956 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 PPP1R12C-201ENST00000263433 2924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
PDE6HQ13956 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
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