Protein–RNA interactions for Protein: Q13838

DDX39B, Spliceosome RNA helicase DDX39B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 428 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX39BQ13838 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 HMGA2-202ENST00000393577 611 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 Z92544.1-202ENST00000571933 1220 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
DDX39BQ13838 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 NAA30-203ENST00000555166 1294 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 RNF40-201ENST00000324685 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 PITX2-209ENST00000557119 1889 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 IGDCC4-201ENST00000352385 6508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
DDX39BQ13838 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
DDX39BQ13838 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
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