Protein–RNA interactions for Protein: Q13790

APOF, Apolipoprotein F, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOFQ13790 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOFQ13790 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOFQ13790 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
APOFQ13790 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOFQ13790 TSPAN4-202ENST00000397396 1332 ntTSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOFQ13790 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOFQ13790 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
APOFQ13790 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOFQ13790 GGH-201ENST00000260118 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOFQ13790 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
APOFQ13790 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOFQ13790 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOFQ13790 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOFQ13790 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOFQ13790 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOFQ13790 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOFQ13790 INAFM2-202ENST00000638170 3052 ntAPPRIS P1 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOFQ13790 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOFQ13790 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOFQ13790 SYT7-206ENST00000540677 2013 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOFQ13790 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOFQ13790 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOFQ13790 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOFQ13790 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOFQ13790 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOFQ13790 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
APOFQ13790 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOFQ13790 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOFQ13790 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOFQ13790 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOFQ13790 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC20.87■□□□□ 0.93
APOFQ13790 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOFQ13790 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOFQ13790 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
APOFQ13790 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
APOFQ13790 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOFQ13790 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOFQ13790 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOFQ13790 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOFQ13790 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOFQ13790 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOFQ13790 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC20.86■□□□□ 0.93
APOFQ13790 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOFQ13790 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOFQ13790 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOFQ13790 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
APOFQ13790 SOX21-201ENST00000376945 2778 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOFQ13790 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOFQ13790 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOFQ13790 YTHDF3-214ENST00000621890 2296 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOFQ13790 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOFQ13790 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOFQ13790 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOFQ13790 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOFQ13790 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOFQ13790 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOFQ13790 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOFQ13790 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOFQ13790 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOFQ13790 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOFQ13790 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOFQ13790 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC20.85■□□□□ 0.93
APOFQ13790 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOFQ13790 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOFQ13790 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOFQ13790 FAM193B-217ENST00000514747 2913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOFQ13790 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOFQ13790 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
APOFQ13790 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOFQ13790 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.84■□□□□ 0.93
APOFQ13790 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
APOFQ13790 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOFQ13790 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOFQ13790 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOFQ13790 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOFQ13790 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOFQ13790 LURAP1L-201ENST00000319264 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOFQ13790 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOFQ13790 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOFQ13790 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOFQ13790 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOFQ13790 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
APOFQ13790 SLC35A2-209ENST00000452555 1563 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOFQ13790 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOFQ13790 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOFQ13790 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOFQ13790 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOFQ13790 SLC9A3R1-201ENST00000262613 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOFQ13790 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOFQ13790 NKAIN3-202ENST00000523211 1988 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOFQ13790 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
APOFQ13790 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOFQ13790 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOFQ13790 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOFQ13790 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOFQ13790 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOFQ13790 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOFQ13790 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOFQ13790 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
APOFQ13790 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
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