Protein–RNA interactions for Protein: Q13698

CACNA1S, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, humanhuman

Predictions only

Length 1,873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1SQ13698 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 IQANK1-201ENST00000527139 1803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
CACNA1SQ13698 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.01■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 AC005410.1-201ENST00000579522 462 ntTSL 3 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 LENG1-201ENST00000222224 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 H2AFB3-201ENST00000615853 591 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
CACNA1SQ13698 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 COX4I1-216ENST00000568794 794 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CACNA1SQ13698 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
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