Protein–RNA interactions for Protein: Q13639

HTR4, 5-hydroxytryptamine receptor 4, humanhuman

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Length 388 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR4Q13639 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
HTR4Q13639 FNTA-201ENST00000302279 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 MRPS7-203ENST00000579002 1638 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HTR4Q13639 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HTR4Q13639 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
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