Protein–RNA interactions for Protein: Q13616

CUL1, Cullin-1, humanhuman

Predictions only

Length 776 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL1Q13616 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 HIRA-201ENST00000263208 4053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 IRX2-201ENST00000302057 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 SLC18A3-201ENST00000374115 2420 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
CUL1Q13616 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 CCNYL1-202ENST00000339882 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
CUL1Q13616 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.5 ms