Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 CHST6-202ENST00000390664 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 AL355987.3-201ENST00000456614 735 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ITGB3BPQ13352 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 PRSS22-201ENST00000161006 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 SUDS3P1-201ENST00000505831 966 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 FAM174B-207ENST00000555748 866 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ITGB3BPQ13352 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 LIN7B-202ENST00000391864 582 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 RAB6B-203ENST00000469959 500 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 HOXD4-201ENST00000306324 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 FGF8-204ENST00000347978 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 BAG1-212ENST00000641048 1038 ntAPPRIS P3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 GRAMD4P4-201ENST00000613563 1115 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 AL355001.2-201ENST00000620617 1191 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ITGB3BPQ13352 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
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