Protein–RNA interactions for Protein: Q13315

ATM, Serine-protein kinase ATM, humanhuman

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Length 3,056 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATMQ13315 CD24-202ENST00000610952 802 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATMQ13315 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATMQ13315 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
ATMQ13315 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATMQ13315 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
ATMQ13315 RBMXL2-201ENST00000306904 1874 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATMQ13315 TMEM104-205ENST00000582773 1740 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATMQ13315 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATMQ13315 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATMQ13315 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATMQ13315 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATMQ13315 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATMQ13315 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATMQ13315 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATMQ13315 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATMQ13315 MRPS2-202ENST00000371785 1640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATMQ13315 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATMQ13315 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATMQ13315 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATMQ13315 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
ATMQ13315 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATMQ13315 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATMQ13315 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATMQ13315 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATMQ13315 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATMQ13315 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATMQ13315 SCARA5-204ENST00000524352 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATMQ13315 MAPKAP1-207ENST00000394060 1586 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATMQ13315 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATMQ13315 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
ATMQ13315 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
ATMQ13315 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 TMEM98-202ENST00000394642 1683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ATMQ13315 DBI-210ENST00000542275 757 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATMQ13315 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATMQ13315 MATK-204ENST00000585778 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATMQ13315 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATMQ13315 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATMQ13315 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ATMQ13315 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATMQ13315 WWOX-218ENST00000627394 894 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATMQ13315 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATMQ13315 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATMQ13315 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATMQ13315 AP001160.5-201ENST00000636508 485 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATMQ13315 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ATMQ13315 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATMQ13315 PKMYT1-211ENST00000573944 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATMQ13315 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATMQ13315 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATMQ13315 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ATMQ13315 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ATMQ13315 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATMQ13315 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATMQ13315 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATMQ13315 PDXDC2P-202ENST00000527016 543 ntTSL 3 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATMQ13315 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATMQ13315 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ATMQ13315 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ATMQ13315 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ATMQ13315 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 CD99P1-205ENST00000527459 561 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ATMQ13315 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATMQ13315 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATMQ13315 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
ATMQ13315 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
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