Protein–RNA interactions for Protein: Q13216

ERCC8, DNA excision repair protein ERCC-8, humanhuman

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Length 396 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERCC8Q13216 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 PARD3-214ENST00000545693 5962 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
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ERCC8Q13216 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ERCC8Q13216 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
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ERCC8Q13216 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC16.89■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 CLIC3-203ENST00000494426 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ERCC8Q13216 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
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ERCC8Q13216 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 ZBED3-201ENST00000255198 6172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
ERCC8Q13216 MIR4281-201ENST00000580852 62 ntBASIC16.86■□□□□ 0.29
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