Protein–RNA interactions for Protein: Q13214

SEMA3B, Semaphorin-3B, humanhuman

Predictions only

Length 749 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3BQ13214 GUK1-205ENST00000366722 850 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 EBPL-204ENST00000378272 766 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SEMA3BQ13214 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 AC092068.2-201ENST00000590491 1708 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 CBR3-201ENST00000290354 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 KDELR3-202ENST00000409006 931 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 QDPR-206ENST00000508623 601 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 ZFAND4-205ENST00000374371 2283 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 SURF2-201ENST00000371964 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 ZNRF2P3-201ENST00000424200 374 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 RBPMS2-201ENST00000300069 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 DCTPP1-201ENST00000319285 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 MYL5-208ENST00000511290 781 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SEMA3BQ13214 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 AC009097.2-201ENST00000562763 465 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 ERF-201ENST00000222329 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 FBXW4-201ENST00000331272 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 MRPL41-201ENST00000371443 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
SEMA3BQ13214 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
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