Protein–RNA interactions for Protein: Q13148

TARDBP, TAR DNA-binding protein 43, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 414 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TARDBPQ13148 IFNAR2-201ENST00000342101 2606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.46□□□□□ -0.416e-7■■■■■ 31.1
TARDBPQ13148 IFNAR2-205ENST00000404220 4284 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.83□□□□□ -0.526e-7■■■■■ 31.1
TARDBPQ13148 IFNAR2-210ENST00000447980 726 ntTSL 511.56□□□□□ -0.566e-7■■■■■ 31.1
TARDBPQ13148 IFNAR2-206ENST00000413881 710 ntTSL 5 BASIC5.36□□□□□ -1.556e-7■■■■■ 31.1
TARDBPQ13148 IFNAR2-209ENST00000443073 841 ntTSL 54.24□□□□□ -1.736e-7■■■■■ 31.1
TARDBPQ13148 KMT2C-201ENST00000262189 16862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 31.1
TARDBPQ13148 KMT2C-212ENST00000558084 16862 ntTSL 1 (best)7.07□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 31.1
TARDBPQ13148 KMT2C-202ENST00000355193 16858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.07□□□□□ -1.281e-6■■■■■ 31.1
TARDBPQ13148 LRIG2-205ENST00000492207 5076 ntTSL 56.89□□□□□ -1.314e-9■■■■■ 31
TARDBPQ13148 LRIG2-203ENST00000466161 3366 ntTSL 25.73□□□□□ -1.494e-9■■■■■ 31
TARDBPQ13148 MALAT1-208ENST00000616527 572 ntTSL 3 BASIC7.28□□□□□ -1.241e-323■■■■■ 31
TARDBPQ13148 MALAT1-216ENST00000620465 333 ntTSL 24.55□□□□□ -1.681e-323■■■■■ 31
TARDBPQ13148 AK2-212ENST00000550338 886 ntTSL 213.75□□□□□ -0.213e-10■■■■■ 31
TARDBPQ13148 AK2-208ENST00000487289 920 ntTSL 2 BASIC12.72□□□□□ -0.373e-10■■■■■ 31
TARDBPQ13148 CYTOR-202ENST00000409054 1096 ntTSL 2 BASIC12.06□□□□□ -0.481e-6■■■■■ 31
TARDBPQ13148 CYTOR-204ENST00000409898 560 ntTSL 5 BASIC7.88□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 31
TARDBPQ13148 CYTOR-214ENST00000629257 323 ntTSL 56.46□□□□□ -1.381e-6■■■■■ 31
TARDBPQ13148 CYTOR-203ENST00000409139 519 ntTSL 34.77□□□□□ -1.651e-6■■■■■ 31
TARDBPQ13148 NUTM2B-AS1-209ENST00000596088 366 ntTSL 3 BASIC6.83□□□□□ -1.322e-6■■■■■ 31
TARDBPQ13148 NUTM2B-AS1-210ENST00000600376 510 ntTSL 35.77□□□□□ -1.492e-6■■■■■ 31
TARDBPQ13148 C1orf27-203ENST00000419367 1900 ntTSL 2 BASIC10.31□□□□□ -0.765e-8■■■■■ 31
TARDBPQ13148 C1orf27-202ENST00000367470 3754 ntTSL 5 BASIC6.39□□□□□ -1.395e-8■■■■■ 31
TARDBPQ13148 C1orf27-201ENST00000287859 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.8□□□□□ -1.485e-8■■■■■ 31
TARDBPQ13148 ELK4-204ENST00000616704 2535 ntTSL 223.84■■□□□ 1.417e-31■■■■■ 31
TARDBPQ13148 ELK4-202ENST00000357992 10239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.217e-31■■■■■ 31
TARDBPQ13148 PKNOX1-201ENST00000291547 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.55□□□□□ -0.721e-8■■■■■ 31
TARDBPQ13148 PKNOX1-203ENST00000432907 5180 ntTSL 2 BASIC10.22□□□□□ -0.771e-8■■■■■ 31
TARDBPQ13148 ADAT2-203ENST00000606514 6651 ntTSL 1 (best) BASIC3.52□□□□□ -1.853e-20■■■■■ 31
TARDBPQ13148 AC079781.5-201ENST00000641390 3211 nt17.43■□□□□ 0.382e-6■■■■■ 31
TARDBPQ13148 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC14.33□□□□□ -0.122e-6■■■■■ 31
TARDBPQ13148 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.363e-7■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 TMCO3-205ENST00000465556 314 ntTSL 311.99□□□□□ -0.493e-7■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 ADAT2-201ENST00000237283 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.96□□□□□ -0.811e-19■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 EEF1AKMT2-205ENST00000495711 524 ntTSL 24.66□□□□□ -1.661e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 OXSR1-202ENST00000426620 1581 ntTSL 1 (best)22.69■■□□□ 1.221e-7■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.24■□□□□ 0.351e-17■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.341e-17■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 ELOF1-205ENST00000589171 743 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.171e-17■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.041e-17■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 BTBD2-206ENST00000589200 858 ntTSL 523.34■■□□□ 1.332e-7■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.122e-7■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 BTBD2-208ENST00000590646 572 ntTSL 414.71□□□□□ -0.052e-7■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 BTBD2-205ENST00000588395 352 ntTSL 513.88□□□□□ -0.192e-7■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 BTBD2-203ENST00000587742 559 ntTSL 513.32□□□□□ -0.282e-7■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.626e-7■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 AGAP1-214ENST00000635100 2478 ntTSL 514.53□□□□□ -0.086e-7■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 AGAP1-201ENST00000304032 10832 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.87□□□□□ -0.196e-7■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 LINC01169-201ENST00000558797 833 ntTSL 1 (best) BASIC10.77□□□□□ -0.693e-8■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 RASA1-206ENST00000515800 4979 ntTSL 1 (best)15.92■□□□□ 0.145e-17■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.015e-17■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.941e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.821e-9■■■■■ 30.9
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TARDBPQ13148 PFKFB3-214ENST00000490474 2086 ntTSL 518.64■□□□□ 0.571e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 PFKFB3-212ENST00000477914 2063 ntTSL 518.58■□□□□ 0.571e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 PFKFB3-202ENST00000360521 1964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.561e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.541e-9■■■■■ 30.9
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TARDBPQ13148 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.431e-9■■■■■ 30.9
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TARDBPQ13148 PFKFB3-208ENST00000450232 595 ntTSL 315.71■□□□□ 0.111e-9■■■■■ 30.9
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TARDBPQ13148 HSPA9-204ENST00000504902 887 ntTSL 515.01□□□□□ -0.011e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 HSPA9-205ENST00000505110 518 ntTSL 414.51□□□□□ -0.091e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 PFKFB3-213ENST00000487989 661 ntTSL 214.04□□□□□ -0.161e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 MTCL1-202ENST00000359865 6093 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.231e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 HSPA9-207ENST00000507097 1796 ntTSL 213.09□□□□□ -0.311e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC13.01□□□□□ -0.331e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 PFKFB3-206ENST00000414237 513 ntTSL 1 (best)12.42□□□□□ -0.421e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 TESMIN-206ENST00000540869 724 ntTSL 312.39□□□□□ -0.431e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 PFKFB3-203ENST00000379775 4483 ntTSL 1 (best) BASIC12.23□□□□□ -0.451e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 HSPA9-201ENST00000297185 3321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.851e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 HSPA9-208ENST00000507115 663 ntTSL 39.34□□□□□ -0.911e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 HSPA9-203ENST00000504810 584 ntTSL 37.97□□□□□ -1.131e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 NSUN6-201ENST00000377304 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC7.5□□□□□ -1.211e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 MTCL1-212ENST00000522146 580 ntTSL 46.43□□□□□ -1.381e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 TESMIN-205ENST00000538944 398 ntTSL 24.6□□□□□ -1.671e-9■■■■■ 30.9
TARDBPQ13148 ALG13-223ENST00000495283 3236 ntTSL 210.13□□□□□ -0.791e-6■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 ALG13-225ENST00000621367 3893 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.881e-6■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 ALG13-228ENST00000623144 3693 ntTSL 29.07□□□□□ -0.961e-6■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 ALG13-229ENST00000623148 3689 ntTSL 28.88□□□□□ -0.991e-6■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 ALG13-204ENST00000436609 3812 ntTSL 5 BASIC8.65□□□□□ -1.031e-6■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 ALG13-201ENST00000251943 3997 ntTSL 2 BASIC7.84□□□□□ -1.151e-6■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 ALG13-224ENST00000610588 4175 ntTSL 2 BASIC7.16□□□□□ -1.261e-6■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 ALG13-203ENST00000394780 4133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC5.89□□□□□ -1.471e-6■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 ALG13-239ENST00000636363 3480 ntTSL 54.98□□□□□ -1.611e-6■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 ALG13-234ENST00000624161 3761 ntTSL 24.55□□□□□ -1.681e-6■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 ALG13-209ENST00000470971 3200 ntTSL 53.55□□□□□ -1.841e-6■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 XPO6-223ENST00000574435 765 ntTSL 515.36■□□□□ 0.054e-9■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 XPO6-217ENST00000569973 544 ntTSL 415.34■□□□□ 0.054e-9■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.064e-9■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 TMEM2-202ENST00000377044 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.233e-17■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 XPO6-222ENST00000573645 509 ntTSL 312.23□□□□□ -0.454e-9■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 XPO6-208ENST00000565698 4255 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.694e-9■■■■■ 30.8
TARDBPQ13148 TMEM2-204ENST00000377057 2637 ntTSL 29.46□□□□□ -0.93e-17■■■■■ 30.8
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