Protein–RNA interactions for Protein: Q13011

ECH1, Delta(3,5)-Delta(2,4)-dienoyl-CoA isomerase, mitochondrial, humanhuman

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Length 328 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECH1Q13011 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC19.76■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 SPON2-222ENST00000617421 2156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC19.74■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 TMEM185B-201ENST00000426077 2131 ntAPPRIS P1 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 C11orf63-201ENST00000227349 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 CACNG6-203ENST00000352529 1635 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 EEF1D-256ENST00000618139 2238 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 NPW-201ENST00000329610 498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 LAT-217ENST00000630764 610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 ATP11C-203ENST00000370557 6924 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 MFSD7-201ENST00000322224 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 HMX3-201ENST00000357878 1173 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 C5orf49-201ENST00000399810 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
ECH1Q13011 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 AC092028.1-203ENST00000608262 953 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
ECH1Q13011 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
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