Protein–RNA interactions for Protein: Q13002

GRIK2, Glutamate receptor ionotropic, kainate 2, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK2Q13002 FAM21EP-202ENST00000456967 2177 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 CDYL-203ENST00000397588 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 DLK2-202ENST00000372485 1572 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 NRXN1-205ENST00000401710 2873 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 CYC1-201ENST00000318911 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 GET4-201ENST00000265857 2090 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 TTLL11-202ENST00000373776 2012 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 C7orf25-206ENST00000447342 1823 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 CBWD3-212ENST00000616550 721 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 CBWD6-216ENST00000617933 721 ntTSL 3 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 VPS53-211ENST00000571805 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 AC004707.1-201ENST00000511627 715 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 CCDC96-201ENST00000310085 2091 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 LTB4R2-205ENST00000543919 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 TRAP1-202ENST00000538171 2052 ntTSL 2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
GRIK2Q13002 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 TMSB15B-202ENST00000436583 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 RHOF-204ENST00000537265 699 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 RARA-AS1-201ENST00000581080 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 ST3GAL5-214ENST00000638178 2034 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 SIAH2-201ENST00000312960 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK2Q13002 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
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