Protein–RNA interactions for Protein: Q12983

BNIP3, BCL2/adenovirus E1B 19 kDa protein-interacting protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNIP3Q12983 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 MATK-202ENST00000395040 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 AC011298.3-201ENST00000615796 283 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 ZNF503-AS2-201ENST00000425916 2026 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 NRIP3-203ENST00000531090 980 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 AC027682.1-201ENST00000562846 899 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
BNIP3Q12983 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 RGS19-201ENST00000332298 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 NR2F1-AS1-214ENST00000607831 1963 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 PCSK6-220ENST00000622483 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 PCMT1-202ENST00000367380 1628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 PCMT1-211ENST00000544496 1628 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 IRS3P-201ENST00000223076 1006 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
BNIP3Q12983 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.3 ms