Protein–RNA interactions for Protein: Q12872

SFSWAP, Splicing factor, suppressor of white-apricot homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 951 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFSWAPQ12872 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 SERGEF-219ENST00000532265 1124 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 FBXO33-202ENST00000554190 534 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 NKX2-2-AS1-201ENST00000549659 638 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 GJD3-201ENST00000578689 885 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 AEBP2-204ENST00000398864 5099 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 MRPL46-201ENST00000312475 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 PAFAH1B2-205ENST00000529887 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 LLGL2-202ENST00000375227 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.7■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
SFSWAPQ12872 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 LBX2-202ENST00000377566 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 CCDC107-205ENST00000421582 1324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 WNT11-201ENST00000322563 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 AC068580.1-201ENST00000446489 252 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 CA15P2-201ENST00000611168 834 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 CTAG2-202ENST00000369585 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 RBM38-205ENST00000440234 686 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 PPM1N-207ENST00000451287 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 LINC00472-204ENST00000436803 667 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 RASGEF1B-208ENST00000510780 539 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 RASGEF1B-209ENST00000512343 498 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SFSWAPQ12872 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
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