Protein–RNA interactions for Protein: Q0VAF6

SYCN, Syncollin, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCNQ0VAF6 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 CTDSP2-203ENST00000547701 988 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 RANBP10-206ENST00000602677 2374 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 SHISA7-201ENST00000376325 6033 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC14.78□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 RABEP2-201ENST00000357573 2175 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
SYCNQ0VAF6 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 MEF2A-202ENST00000354410 5824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
SYCNQ0VAF6 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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