Protein–RNA interactions for Protein: Q09161

NCBP1, Nuclear cap-binding protein subunit 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 790 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCBP1Q09161 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 SPSB3-208ENST00000566339 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
NCBP1Q09161 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 GAS1-201ENST00000298743 2827 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 UBTD1-201ENST00000370664 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 SLC35B2-202ENST00000393812 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 RFNG-201ENST00000310496 1828 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 CDKN2B-202ENST00000380142 859 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 TDRKH-205ENST00000368827 2318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 DACT3-202ENST00000391916 2834 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 PTOV1-201ENST00000391842 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 SLC52A2-202ENST00000402965 1777 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 AUH-201ENST00000303617 1490 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 GSN-204ENST00000373818 2657 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 BSN-AS2-201ENST00000421598 2603 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 ARHGAP29-202ENST00000370217 2043 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NCBP1Q09161 ZKSCAN7-206ENST00000431636 1692 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 GRK4-202ENST00000398051 2068 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 ZNF641-205ENST00000547026 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 TMEM51-205ENST00000434578 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 PNLIPRP2-205ENST00000611850 1407 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NCBP1Q09161 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms