Protein–RNA interactions for Protein: Q07912

TNK2, Activated CDC42 kinase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,038 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNK2Q07912 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 AP006621.3-202ENST00000530083 765 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.35
TNK2Q07912 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 STOX1-202ENST00000399162 935 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 STOX1-203ENST00000399165 1135 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 ACAP1-206ENST00000571471 320 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 AC104564.3-201ENST00000582367 638 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 AC091982.4-201ENST00000623943 726 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 R3HDM4-201ENST00000361574 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 SYF2-201ENST00000236273 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 LKAAEAR1-201ENST00000302096 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 LKAAEAR1-202ENST00000308906 868 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 MIR6821-201ENST00000617625 74 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 ANKRD20A6P-201ENST00000618763 204 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 AC104564.5-201ENST00000584986 278 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 AC136469.2-201ENST00000623944 1028 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 ARFIP2-202ENST00000396777 1868 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 RAB40B-201ENST00000269347 2189 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 HSD11B2-201ENST00000326152 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 PLPP5-201ENST00000419686 794 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 CREB3L2-203ENST00000452463 1105 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 LRRC75A-203ENST00000470794 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 ID2-201ENST00000234091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TNK2Q07912 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 C15orf61-202ENST00000557807 769 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 MYDGF-203ENST00000599630 713 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 HRH3-203ENST00000611492 900 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 PRMT5-213ENST00000553897 1857 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TNK2Q07912 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.2 ms