Protein–RNA interactions for Protein: Q07889

SOS1, Son of sevenless homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,333 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOS1Q07889 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 GLTPD2-201ENST00000331264 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC29.2■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 KCTD5-201ENST00000301738 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 HOMER2-201ENST00000304231 1990 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 CDC37L1-202ENST00000381858 1244 ntTSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 TSPY4-201ENST00000383008 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 NGEF-203ENST00000409079 1022 ntTSL 1 (best) BASIC29.19■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 ARPC5L-201ENST00000259477 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 AC008105.3-201ENST00000586376 844 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC29.18■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 SIRT3-215ENST00000532956 1235 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC29.16■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 HYI-204ENST00000372432 1066 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 WISP2-203ENST00000372868 1600 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
SOS1Q07889 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 AC007448.3-201ENST00000585193 689 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 DIRAS1-202ENST00000585334 774 ntAPPRIS P1 BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 FRMD8-208ENST00000531296 366 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 AC233992.3-201ENST00000607491 485 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 MPST-208ENST00000628507 698 ntTSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 LINC01678-201ENST00000411694 863 ntTSL 5 BASIC29.11■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 BX842568.3-201ENST00000418104 571 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC29.1■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 TRIR-201ENST00000242784 970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 NDUFB2-201ENST00000247866 504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 SNX3-202ENST00000349379 890 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 MGAT5B-207ENST00000565675 872 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 TRAF4-217ENST00000618771 543 ntTSL 5 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC29.09■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
SOS1Q07889 ACP4-201ENST00000270593 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SOS1Q07889 GDNF-203ENST00000381826 778 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SOS1Q07889 GDNF-204ENST00000427982 856 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
SOS1Q07889 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SOS1Q07889 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC29.07■■■□□ 2.24
SOS1Q07889 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SOS1Q07889 SRM-201ENST00000376957 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
SOS1Q07889 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms