Protein–RNA interactions for Protein: Q07011

TNFRSF9, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 9, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF9Q07011 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 SPATA2L-201ENST00000289805 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 RBM42-205ENST00000589871 1487 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 RBFOX2-209ENST00000438146 1356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
TNFRSF9Q07011 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 ZNF843-201ENST00000315678 2137 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 TMEM200B-201ENST00000420504 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 NIPA2-203ENST00000398013 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 P4HA2-202ENST00000360568 2313 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 HOMER3-205ENST00000542541 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 UBE2Q1-201ENST00000292211 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 NBL1-202ENST00000375136 2172 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 AC012123.1-201ENST00000426194 1661 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 IRX4-201ENST00000231357 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 PPP5C-201ENST00000012443 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 HERC2P9-201ENST00000507787 1023 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 C2orf72-201ENST00000373640 3657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 MAG-203ENST00000537831 2341 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 PRPSAP2-201ENST00000268835 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 KCNQ5-205ENST00000370398 6345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 FOXJ1-201ENST00000322957 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 ANKHD1-204ENST00000394722 2035 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 SH2D3A-201ENST00000245908 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 LMLN-210ENST00000482695 2010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 SARDH-203ENST00000371868 2266 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 TBL1Y-203ENST00000383032 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 PGF-206ENST00000555567 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 CACNB3-205ENST00000547392 2237 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 TMEM200B-202ENST00000521452 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 MRGPRF-203ENST00000441623 2282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 AKT2-234ENST00000579047 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TNFRSF9Q07011 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 385.6 ms