Protein–RNA interactions for Protein: Q06683

IRC3, Putative ATP-dependent helicase IRC3, yeastyeast

Predictions only

Length 689 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
IRC3Q06683 RPS4AYJR145C 786 nt5.41□□□□□ -1.54
IRC3Q06683 NCE103YNL036W 666 nt5.41□□□□□ -1.54
IRC3Q06683 YOR379CYOR379C 339 nt5.41□□□□□ -1.54
IRC3Q06683 SNF8YPL002C 702 nt5.41□□□□□ -1.54
IRC3Q06683 UBS1YBR165W 834 nt5.41□□□□□ -1.54
IRC3Q06683 RER1YCL001W 567 nt5.41□□□□□ -1.54
IRC3Q06683 GSH2YOL049W 1476 nt5.4□□□□□ -1.54
IRC3Q06683 PCL9YDL179W 915 nt5.4□□□□□ -1.54
IRC3Q06683 NTR2YKR022C 969 nt5.4□□□□□ -1.54
IRC3Q06683 ECM32YER176W 3366 nt5.4□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 GCN20YFR009W 2259 nt5.4□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 CPR4YCR069W 957 nt5.39□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 YER145C-AYER145C-A 438 nt5.39□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 tS(AGA)D3tS(AGA)D3 83 nt5.39□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 ATP12YJL180C 978 nt5.39□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 YMR086C-AYMR086C-A 339 nt5.39□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 YOL038C-AYOL038C-A 96 nt5.39□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 TIP20YGL145W 2106 nt5.39□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 YDR132CYDR132C 1488 nt5.39□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 KAR2YJL034W 2049 nt5.38□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 IMD3YLR432W 1572 nt5.38□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 CNB1YKL190W 528 nt5.38□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 PRO2YOR323C 1371 nt5.38□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 SMP1YBR182C 1359 nt5.38□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 LDB17YDL146W 1476 nt5.38□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 IXR1YKL032C 1794 nt5.37□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 RCR2YDR003W 633 nt5.37□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 GCV1YDR019C 1203 nt5.37□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 FSH1YHR049W 732 nt5.37□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 NEJ1YLR265C 1029 nt5.37□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 RAD17YOR368W 1206 nt5.37□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 GRE1YPL223C 507 nt5.37□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 MST1YKL194C 1389 nt5.37□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 OMS1YDR316W 1416 nt5.37□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 YER133W-AYER133W-A 342 nt5.36□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 YLR296WYLR296W 327 nt5.36□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 snR3snR3 194 nt5.36□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 STP4YDL048C 1473 nt5.36□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 TOS3YGL179C 1683 nt5.36□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 SIA1YOR137C 1869 nt5.36□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 MET12YPL023C 1974 nt5.36□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 TRE1YPL176C 2352 nt5.36□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 SAP4YGL229C 2457 nt5.36□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 MEF2YJL102W 2460 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 SKM1YOL113W 1968 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 GIP2YER054C 1647 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 UBX7YBR273C 1311 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 TMA17YDL110C 453 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 BUD16YEL029C 939 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 SUP56tL(CAA)A 82 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 SUP53tL(CAA)C 82 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 tL(CAA)DtL(CAA)D 82 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 tL(CAA)G1tL(CAA)G1 82 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 SUP54tL(CAA)G2 82 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 tL(CAA)G3tL(CAA)G3 82 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 tL(CAA)KtL(CAA)K 82 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 tL(CAA)LtL(CAA)L 82 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 tL(CAA)MtL(CAA)M 82 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 tL(CAA)NtL(CAA)N 82 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 PCT1YGR202C 1275 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 YLR169WYLR169W 354 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 YLR198CYLR198C 360 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 YMR075C-AYMR075C-A 366 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 YNL319WYNL319W 441 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 GPI2YPL076W 843 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 YDC1YPL087W 954 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 KEX1YGL203C 2190 nt5.35□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 YER138W-AYER138W-A 105 nt5.34□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 MTM1YGR257C 1101 nt5.34□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 YLL017WYLL017W 312 nt5.34□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 YBL107W-AYBL107W-A 105 nt5.34□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 TGL4YKR089C 2733 nt5.34□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 YDL109CYDL109C 1944 nt5.34□□□□□ -1.55
IRC3Q06683 TDA11YHR159W 1515 nt5.33□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 YDR161WYDR161W 1164 nt5.33□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 SUT1YGL162W 900 nt5.33□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 UTP11YKL099C 753 nt5.33□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 PML1YLR016C 615 nt5.33□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 SPG4YMR107W 348 nt5.33□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 YPR109WYPR109W 885 nt5.33□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 QCR2YPR191W 1107 nt5.33□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 ABF1YKL112W 2196 nt5.33□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 NMD3YHR170W 1557 nt5.33□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 ATG32YIL146C 1590 nt5.33□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 RKM2YDR198C 1440 nt5.32□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 KGD1YIL125W 3045 nt5.32□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 MNN2YBR015C 1794 nt5.32□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 ARG4YHR018C 1392 nt5.32□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 CLD1YGR110W 1338 nt5.32□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 LUC7YDL087C 786 nt5.32□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 COA3YJL062W-A 258 nt5.32□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 BAG7YOR134W 1230 nt5.32□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 KIN2YLR096W 3444 nt5.32□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 CTF18YMR078C 2226 nt5.32□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 SED4YCR067C 3198 nt5.32□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 RSC6YCR052W 1452 nt5.32□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 SEO1YAL067C 1782 nt5.32□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 PDR15YDR406W 4590 nt5.31□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 RPC53YDL150W 1269 nt5.31□□□□□ -1.56
IRC3Q06683 DBF4YDR052C 2115 nt5.31□□□□□ -1.56
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.1 ms