Protein–RNA interactions for Protein: Q06124

PTPN11, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 597 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN11Q06124 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 NEBL-AS1-202ENST00000439097 661 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 SDF4-202ENST00000360001 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 LINC01167-201ENST00000423232 604 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 SLC47A1P1-202ENST00000449666 945 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
PTPN11Q06124 NME4-201ENST00000219479 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 SLC19A1-202ENST00000380010 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 PRELID2-204ENST00000505416 738 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
PTPN11Q06124 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
PTPN11Q06124 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms