Protein–RNA interactions for Protein: Q05940

SLC18A2, Synaptic vesicular amine transporter, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC18A2Q05940 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 AC005906.2-202ENST00000638821 2168 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 FAM162B-201ENST00000368557 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 NFKBID-201ENST00000396901 1834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 NFKBID-211ENST00000641389 1834 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 ADAD2-201ENST00000268624 2283 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 RAPH1-210ENST00000453034 2394 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 AC007375.3-201ENST00000600936 2314 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 SPAG16-202ENST00000331683 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 MYCN-201ENST00000281043 2602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 SOAT2-201ENST00000301466 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 CARMIL1-202ENST00000461945 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 TCEA1-213ENST00000640041 1171 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 SH2B1-204ENST00000395532 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
SLC18A2Q05940 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 GAS2L1-206ENST00000610653 2238 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 BRWD1-202ENST00000341322 2495 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
SLC18A2Q05940 VGLL3-201ENST00000383698 2475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.3 ms