Protein–RNA interactions for Protein: Q04323

UBXN1, UBX domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN1Q04323 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 STEAP2-207ENST00000402625 1372 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 GUSBP5-202ENST00000510805 1989 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 NEURL4-201ENST00000315614 5182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
UBXN1Q04323 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 ZNF606-203ENST00000547121 1196 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 HNRNPM-202ENST00000348943 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 SH3GLB2-203ENST00000372564 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
UBXN1Q04323 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
UBXN1Q04323 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms