Protein–RNA interactions for Protein: Q04304

YMR090W, UPF0659 protein YMR090W, yeast

Known RBP Predictions only

Length 227 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
YMR090W	Q04304	DBR1	YKL149C	1218 nt		3.56	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	SHE1	YBL031W	1017 nt		3.56	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	CIN5	YOR028C	888 nt		3.56	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	TRS85	YDR108W	2097 nt		3.56	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	YLR152C	YLR152C	1731 nt		3.56	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	GCR2	YNL199C	1605 nt		3.55	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	ATG2	YNL242W	4779 nt		3.55	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	TPA1	YER049W	1935 nt		3.55	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	YLR407W	YLR407W	687 nt		3.55	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	YGP1	YNL160W	1065 nt		3.55	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	SUI1	YNL244C	327 nt		3.55	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	DCS2	YOR173W	1062 nt		3.55	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	GAL11	YOL051W	3246 nt		3.55	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	BSC5	YNR069C	1470 nt		3.54	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	ATG1	YGL180W	2694 nt		3.54	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	HSP31	YDR533C	714 nt		3.54	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	SIW14	YNL032W	846 nt		3.54	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	PWR1	PWR1	941 nt		3.54	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	HUL4	YJR036C	2679 nt		3.54	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	NOC2	YOR206W	2133 nt		3.53	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	PTA1	YAL043C	2358 nt		3.53	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	HSP42	YDR171W	1128 nt		3.53	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	RPL14A	YKL006W	417 nt		3.53	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	YLR125W	YLR125W	411 nt		3.53	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	TRE1	YPL176C	2352 nt		3.53	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	VHS3	YOR054C	2025 nt		3.53	□□□□□ -1.84
YMR090W	Q04304	FRE7	YOL152W	1863 nt		3.52	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	OCA4	YCR095C	1089 nt		3.52	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	NCE102	YPR149W	522 nt		3.52	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	OM14	YBR230C	405 nt		3.52	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	MMT1	YMR177W	1533 nt		3.52	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	MSS116	YDR194C	1995 nt		3.52	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	GPI18	YBR004C	1302 nt		3.51	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	DIP2	YLR129W	2832 nt		3.51	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	ASP1	YDR321W	1146 nt		3.51	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	CIA2	YHR122W	696 nt		3.51	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	WSS1	YHR134W	810 nt		3.51	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	RDN5-1	RDN5-1	121 nt		3.51	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	RDN5-6	RDN5-6	121 nt		3.51	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	ELA1	YNL230C	1140 nt		3.51	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	EFM2	YBR271W	1260 nt		3.51	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	SIS2	YKR072C	1689 nt		3.51	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	PRM7	YDL039C	2097 nt		3.51	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	YCF1	YDR135C	4548 nt		3.51	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	VID28	YIL017C	2766 nt		3.51	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	URA7	YBL039C	1740 nt		3.5	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	ATP5	YDR298C	639 nt		3.5	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	STP22	YCL008C	1158 nt		3.5	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	SRV2	YNL138W	1581 nt		3.5	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	YSH1	YLR277C	2340 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	MET12	YPL023C	1974 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	ECM22	YLR228C	2445 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	HOS3	YPL116W	2094 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	YDR401W	YDR401W	564 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	YHR112C	YHR112C	1137 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	SEC72	YLR292C	582 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	NKP2	YLR315W	462 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	SSO1	YPL232W	873 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	UBA3	YPR066W	900 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	MST1	YKL194C	1389 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	FLO8	YER109C	2400 nt		3.49	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	ATM1	YMR301C	2073 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	VMA1	YDL185W	3216 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	PRP9	YDL030W	1593 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	TRM8	YDL201W	861 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	NMD4	YLR363C	657 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	PCL1	YNL289W	840 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	FSH3	YOR280C	801 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	GCR1	YPL075W	2358 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	TDA11	YHR159W	1515 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	ARG4	YHR018C	1392 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	YHR177W	YHR177W	1362 nt		3.48	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	NBP2	YDR162C	711 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	ISY1	YJR050W	708 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	YBL059W	YBL059W	582 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	VPS68	YOL129W	555 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	PMT5	YDL093W	2232 nt		3.47	□□□□□ -1.85
YMR090W	Q04304	MNN4	YKL201C	3537 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	CHD1	YER164W	4407 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	SPR6	YER115C	576 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	SRB5	YGR104C	924 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	MID2	YLR332W	1131 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	OCA1	YNL099C	717 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	ICY2	YPL250C	411 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	SRP72	YPL210C	1923 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	BBC1	YJL020C	3474 nt		3.46	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	YML020W	YML020W	1995 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	JAC1	YGL018C	555 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	LSB1	YGR136W	726 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	MRP4	YHL004W	1185 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	YIL014C-A	YIL014C-A	315 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	RFU1	YLR073C	603 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	ORM2	YLR350W	651 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	ECM23	YPL021W	564 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	VPS69	YPR087W	321 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	DBP3	YGL078C	1572 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	CDC14	YFR028C	1656 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	RPB2	YOR151C	3675 nt		3.45	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	CHL1	YPL008W	2586 nt		3.44	□□□□□ -1.86
YMR090W	Q04304	GRS2	YPR081C	1857 nt		3.44	□□□□□ -1.86

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 27.3 ms