Protein–RNA interactions for Protein: Q03169

TNFAIP2, Tumor necrosis factor alpha-induced protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 654 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP2Q03169 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 RTCA-202ENST00000370126 538 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 YBX1P1-201ENST00000445822 960 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 TUNAR-203ENST00000554321 767 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 AC005775.1-201ENST00000592413 850 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 SNCB-206ENST00000614675 1407 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 HACD1-201ENST00000326961 773 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 NMRAL1-202ENST00000404295 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 AL583722.4-201ENST00000555524 716 ntTSL 3 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 NUDT16L1-204ENST00000586536 1406 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
TNFAIP2Q03169 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 KCNMA1-224ENST00000618048 1269 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 AL031602.1-201ENST00000633169 911 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 FPGS-202ENST00000373228 1383 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 AC108002.2-201ENST00000519782 340 ntTSL 4 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 RPLP2-207ENST00000530797 637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 GATA3-AS1-204ENST00000438755 675 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 SLC25A45-206ENST00000526432 894 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 ADSSL1-202ENST00000332972 1969 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 PTGDR-202ENST00000553372 1216 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 IKBKGP1-201ENST00000612193 1073 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 NFKBIB-204ENST00000572515 1929 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
TNFAIP2Q03169 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.1 ms