Protein–RNA interactions for Protein: Q02742

GCNT1, Beta-1,3-galactosyl-O-glycosyl-glycoprotein beta-1,6-N-acetylglucosaminyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 428 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCNT1Q02742 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 HOXD1-201ENST00000331462 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 GDI1-204ENST00000447750 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 C1orf122-202ENST00000373043 2229 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 EPS8L1-205ENST00000586329 2130 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 PEX10-204ENST00000507596 1941 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
GCNT1Q02742 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 BTBD7-205ENST00000554565 2697 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
GCNT1Q02742 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.4 ms