Protein–RNA interactions for Protein: Q01780

EXOSC10, Exosome component 10, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 885 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXOSC10Q01780 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 PHC2-202ENST00000373418 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 C14orf80-211ENST00000450383 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 CACTIN-AS1-201ENST00000592274 1913 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 C9orf163-202ENST00000624034 2573 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 SIX3-201ENST00000260653 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
EXOSC10Q01780 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 DTWD2-204ENST00000515439 1275 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 MIF-201ENST00000215754 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 KRT16P3-201ENST00000439127 1283 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 CCDC194-202ENST00000636079 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 AC068473.5-201ENST00000616428 2072 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.47■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 FMR1-AS1-201ENST00000594922 2005 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 C9orf47-202ENST00000375850 859 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
EXOSC10Q01780 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 EPDR1-202ENST00000423717 638 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 AC136475.3-202ENST00000534742 812 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 PNKP-201ENST00000322344 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 SPNS1-207ENST00000565975 1979 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
EXOSC10Q01780 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.9 ms