Protein–RNA interactions for Protein: Q01118

SCN7A, Sodium channel protein type 7 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 1,682 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN7AQ01118 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 NME4-202ENST00000382940 766 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 NME4-211ENST00000620944 1193 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 SPOCK2-203ENST00000412663 1284 ntTSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 FAM124A-201ENST00000280057 2104 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.48■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC28.45■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.15
SCN7AQ01118 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 ACAD8-202ENST00000374752 1797 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
SCN7AQ01118 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.1 ms