Protein–RNA interactions for Protein: Q01082

SPTBN1, Spectrin beta chain, non-erythrocytic 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,364 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTBN1Q01082 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 AL109923.1-201ENST00000618799 583 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 VDAC2-203ENST00000332211 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 STX7-201ENST00000367937 1090 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
SPTBN1Q01082 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 LY6E-202ENST00000429120 1173 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 UBE2C-203ENST00000352551 665 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 MAP2K4P1-201ENST00000438453 1195 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 GPX1P1-201ENST00000388829 606 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 C19orf24-201ENST00000409293 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 POU5F1-209ENST00000638788 369 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 DYRK2-202ENST00000344096 8912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 AC010336.5-201ENST00000594308 317 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 LDHB-203ENST00000396076 1538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 SERF1A-202ENST00000354833 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 SERF1B-201ENST00000380750 1889 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 ACYP2-201ENST00000303536 789 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 AC096887.1-203ENST00000607203 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.78
SPTBN1Q01082 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTBN1Q01082 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
SPTBN1Q01082 SMOX-203ENST00000339123 2074 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms