Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 IMPA2-212ENST00000625802 500 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 ANKRD53-204ENST00000457410 1671 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 SPI1-201ENST00000227163 1168 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 GADD45A-201ENST00000370985 803 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 EIF6-203ENST00000374450 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 PRDX4-202ENST00000379341 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 NDUFAF8-201ENST00000431388 615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.63
BEX3Q00994 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 KRTAP5-2-201ENST00000412090 1118 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 TRIOBP-203ENST00000403663 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 JARID2-AS1-201ENST00000441978 455 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 CDIPT-210ENST00000570016 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 ATOX1-207ENST00000524142 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 YJEFN3-203ENST00000514277 995 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 LRRC37A17P-202ENST00000570478 572 ntTSL 4 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 ZMYND11-210ENST00000403354 1664 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 AP001005.4-202ENST00000575325 560 ntTSL 4 BASIC25.14■■□□□ 1.62
BEX3Q00994 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC25.13■■□□□ 1.61
BEX3Q00994 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.4 ms