Protein–RNA interactions for Protein: Q00613

HSF1, Heat shock factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 529 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HSF1Q00613 SERBP1P1-201ENST00000396021 1160 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 RARRES2P6-201ENST00000567333 442 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 MIR4767-201ENST00000582827 78 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 ATP10A-207ENST00000619904 988 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
HSF1Q00613 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 PPIL6-203ENST00000440797 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 CAMTA1-208ENST00000473578 567 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 AL136967.2-201ENST00000623968 743 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.57■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 PRADC1-201ENST00000258083 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 STOX2-205ENST00000513034 807 ntTSL 3 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 AP001330.3-201ENST00000520123 633 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 CPSF4-204ENST00000436336 1738 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 RNF223-201ENST00000453464 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 CTSF-201ENST00000310325 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 MIR939-201ENST00000401314 82 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 PTMA-205ENST00000410064 814 ntTSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 PTCHD3P2-201ENST00000424937 1205 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 SIRT3-204ENST00000525319 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 PYGO2-201ENST00000368456 1306 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 HOXD9-201ENST00000249499 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 LAMTOR1-201ENST00000278671 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 SDSL-201ENST00000345635 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 AC099805.1-201ENST00000523987 1797 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 CNTFR-201ENST00000351266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 HSPE1-203ENST00000409729 478 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 MAG-206ENST00000597035 542 ntTSL 4 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 ZNF264-206ENST00000600531 774 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 ACBD4-216ENST00000619916 1276 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 MYCBPAP-202ENST00000419930 1640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
HSF1Q00613 SNX18-201ENST00000326277 2063 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 CENPH-201ENST00000283006 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 GSX2-205ENST00000611459 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 LSR-201ENST00000347609 1880 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 LSR-213ENST00000605618 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 AC026271.2-201ENST00000428091 497 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 AC093249.6-202ENST00000568500 1142 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 SYNGR3-206ENST00000618464 1213 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 ENKD1-206ENST00000602644 1353 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
HSF1Q00613 EIF6-201ENST00000374436 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.8 ms