Protein–RNA interactions for Protein: P98174

FGD1, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 961 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD1P98174 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD1P98174 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD1P98174 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD1P98174 PANK2-201ENST00000316562 2280 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD1P98174 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
FGD1P98174 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD1P98174 MTNR1B-201ENST00000257068 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD1P98174 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD1P98174 PKIG-206ENST00000372892 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD1P98174 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD1P98174 FEZ1-202ENST00000366139 1053 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD1P98174 GUCD1-202ENST00000402766 865 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD1P98174 HNRNPUL1-222ENST00000617774 451 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD1P98174 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
FGD1P98174 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD1P98174 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD1P98174 MRPL38-201ENST00000309352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD1P98174 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD1P98174 SYCE1-204ENST00000432597 1254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD1P98174 ATP11B-209ENST00000493826 963 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD1P98174 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD1P98174 ACTR1B-201ENST00000289228 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD1P98174 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD1P98174 KLC1-205ENST00000380038 2322 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD1P98174 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
FGD1P98174 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGD1P98174 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGD1P98174 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
FGD1P98174 WBP1-203ENST00000409737 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD1P98174 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD1P98174 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD1P98174 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD1P98174 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD1P98174 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD1P98174 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD1P98174 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
FGD1P98174 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD1P98174 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD1P98174 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD1P98174 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD1P98174 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD1P98174 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD1P98174 DACT3-201ENST00000300875 2526 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD1P98174 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
FGD1P98174 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGD1P98174 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGD1P98174 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC26.68■■□□□ 1.86
FGD1P98174 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGD1P98174 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGD1P98174 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGD1P98174 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGD1P98174 LOXL1-201ENST00000261921 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGD1P98174 LRRC61-205ENST00000493307 1456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
FGD1P98174 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGD1P98174 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
FGD1P98174 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGD1P98174 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGD1P98174 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGD1P98174 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGD1P98174 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
FGD1P98174 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGD1P98174 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
FGD1P98174 MEIOB-202ENST00000397344 1792 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGD1P98174 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGD1P98174 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGD1P98174 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGD1P98174 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGD1P98174 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGD1P98174 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGD1P98174 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGD1P98174 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGD1P98174 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
FGD1P98174 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD1P98174 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD1P98174 DONSON-204ENST00000432378 1618 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD1P98174 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD1P98174 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD1P98174 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD1P98174 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD1P98174 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD1P98174 HNRNPUL2-201ENST00000301785 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD1P98174 UNC50-204ENST00000409975 2172 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD1P98174 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD1P98174 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
FGD1P98174 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGD1P98174 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGD1P98174 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGD1P98174 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGD1P98174 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGD1P98174 TCF7L1-201ENST00000282111 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGD1P98174 C12orf75-207ENST00000552457 689 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGD1P98174 GDF6-202ENST00000620978 973 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
FGD1P98174 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FGD1P98174 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
FGD1P98174 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGD1P98174 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGD1P98174 DOHH-201ENST00000427575 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGD1P98174 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGD1P98174 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
FGD1P98174 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.1 ms