Protein–RNA interactions for Protein: P82663

MRPS25, 28S ribosomal protein S25, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 173 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MRPS25P82663 AC137767.1-201ENST00000602918 1920 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 NPAS1-202ENST00000449844 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 CTGF-201ENST00000367976 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 RANBP10-202ENST00000448631 2232 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 HOMER1-202ENST00000334082 5881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 SLC25A1-202ENST00000451283 1514 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
MRPS25P82663 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 KLF3-203ENST00000514033 1871 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 AC242852.2-201ENST00000615738 1807 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
MRPS25P82663 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms