Protein–RNA interactions for Protein: P62306

SNRPF, Small nuclear ribonucleoprotein F, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 86 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPFP62306 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 NKIRAS2-206ENST00000393885 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 HRH3-202ENST00000340177 2659 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 ROR1-202ENST00000371080 2305 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 BRD3-202ENST00000371834 2529 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 GFOD1-204ENST00000603223 2388 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 CDC16-203ENST00000356221 2203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 U2AF1-202ENST00000380276 940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 CDKN2A-207ENST00000497750 565 ntTSL 4 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 CDKN2A-212ENST00000578845 678 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
SNRPFP62306 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 MIR17HG-201ENST00000400282 931 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 FAM136A-201ENST00000037869 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 ASB1-202ENST00000409297 878 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 PEX7-201ENST00000318471 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 C18orf65-201ENST00000622985 2076 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 KLC1-201ENST00000246489 2294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 KLC1-224ENST00000557450 2265 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 GLRX3-201ENST00000331244 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 SRPK3-203ENST00000370104 1753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 CCR10-203ENST00000591765 1942 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 FRS3-202ENST00000373018 2174 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 CHKB-AS1-201ENST00000380711 578 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 LINC01881-206ENST00000614114 957 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 FAM173A-201ENST00000219535 806 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 RPP21-222ENST00000433076 577 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 SRR-208ENST00000576848 588 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 AL512631.2-201ENST00000604634 923 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 NKX6-3-202ENST00000524115 1683 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 CTBP1-203ENST00000382952 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
SNRPFP62306 KRAS-204ENST00000557334 1052 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
SNRPFP62306 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.8 ms