Protein–RNA interactions for Protein: P62304

SNRPE, Small nuclear ribonucleoprotein E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNRPEP62304 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 EPCAM-201ENST00000263735 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 BRD4-202ENST00000360016 3240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 C14orf80-201ENST00000329886 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 SEPT4-205ENST00000426861 1906 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 UNKL-205ENST00000397464 2180 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 KCNA3-201ENST00000369769 2569 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
SNRPEP62304 ANO8-204ENST00000630631 1905 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 RAB5A-201ENST00000273047 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 SOCS2-201ENST00000340600 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 OSCAR-209ENST00000616215 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 AC087289.5-201ENST00000586076 3175 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 AC092490.1-203ENST00000514568 1972 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 ADARB2-202ENST00000381310 1810 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 UBE2Z-201ENST00000360943 3122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 POLR2F-205ENST00000442738 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 ARFRP1-214ENST00000622789 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 CBWD3-201ENST00000360171 2165 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 INTS11-208ENST00000435064 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 NYAP1-202ENST00000454988 2777 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 TMIE-201ENST00000326431 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 NEU4-204ENST00000405370 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 YIPF2-201ENST00000253031 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 OLA1-204ENST00000409546 2071 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 DVL1-204ENST00000610709 2268 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 IGFBP3-210ENST00000613132 2412 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 ULK2-202ENST00000395544 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 FNDC10-201ENST00000422725 2085 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 SPPL2B-212ENST00000618220 2459 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 GALR3-201ENST00000249041 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 LONRF3-202ENST00000371628 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 CLDN23-201ENST00000519106 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 JAKMIP1-203ENST00000409371 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 ZNF510-203ENST00000375231 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 IER2-201ENST00000292433 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 TDRP-203ENST00000523656 2622 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 ALG9-215ENST00000616540 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.37
SNRPEP62304 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
SNRPEP62304 DNAJC7-203ENST00000457167 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.4 ms