Protein–RNA interactions for Protein: P62166

NCS1, Neuronal calcium sensor 1, humanhuman

Predictions only

Length 190 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCS1P62166 NUTF2-201ENST00000219169 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCS1P62166 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
NCS1P62166 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCS1P62166 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCS1P62166 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCS1P62166 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCS1P62166 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCS1P62166 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCS1P62166 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
NCS1P62166 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
NCS1P62166 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCS1P62166 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
NCS1P62166 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCS1P62166 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCS1P62166 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCS1P62166 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
NCS1P62166 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCS1P62166 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCS1P62166 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCS1P62166 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCS1P62166 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCS1P62166 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCS1P62166 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
NCS1P62166 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 AP000662.2-202ENST00000530595 2790 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 EPN1-201ENST00000085079 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 SNAP23-202ENST00000349777 2480 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 NSMCE4A-202ENST00000369023 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
NCS1P62166 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCS1P62166 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCS1P62166 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCS1P62166 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCS1P62166 ECE2-203ENST00000359140 3147 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCS1P62166 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCS1P62166 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
NCS1P62166 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCS1P62166 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCS1P62166 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCS1P62166 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCS1P62166 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCS1P62166 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCS1P62166 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCS1P62166 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCS1P62166 FAM72B-202ENST00000369390 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCS1P62166 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCS1P62166 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCS1P62166 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCS1P62166 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCS1P62166 DAZAP2-201ENST00000412716 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCS1P62166 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCS1P62166 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
NCS1P62166 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 TCEA1-211ENST00000522635 1432 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 MBLAC1-201ENST00000398075 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
NCS1P62166 CFAP97-205ENST00000514798 2895 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCS1P62166 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCS1P62166 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCS1P62166 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCS1P62166 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCS1P62166 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCS1P62166 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
NCS1P62166 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
NCS1P62166 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC20.02■□□□□ 0.79
NCS1P62166 CPSF4-207ENST00000451876 1644 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
NCS1P62166 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCS1P62166 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCS1P62166 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCS1P62166 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
NCS1P62166 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms