Protein–RNA interactions for Protein: P61568

ERVK11-1, Putative endogenous retrovirus group K member 11-1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 191 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK11-1P61568 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 ZYX-201ENST00000322764 2493 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 ARRDC1-AS1-203ENST00000623970 2210 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 OSCAR-203ENST00000356532 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 OSCAR-204ENST00000358375 1389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 OSCAR-210ENST00000616447 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 ASF1B-201ENST00000263382 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
ERVK11-1P61568 GPIHBP1-201ENST00000622500 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 CLDN15-201ENST00000308344 1370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 SLAIN1-213ENST00000466548 2637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 LINC01116-201ENST00000295549 1407 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 FOXP1-201ENST00000318779 843 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 MDK-202ENST00000395565 951 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 MTDHP2-201ENST00000601468 714 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 RMI2-201ENST00000312499 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 PKM-201ENST00000319622 2717 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 IRF2BP1-201ENST00000302165 2564 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 SMAD1-201ENST00000302085 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 AC010997.5-201ENST00000609182 354 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 DONSON-201ENST00000303071 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 CD72-202ENST00000378430 585 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 NKX2-1-201ENST00000354822 2191 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 PLPP2-202ENST00000327790 1397 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 ST3GAL5-268ENST00000640982 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 HES6-204ENST00000409182 863 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 OR2A1-AS1-204ENST00000470435 602 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 CREM-229ENST00000474362 1030 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 OSCAR-201ENST00000284648 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 ABHD6-201ENST00000295962 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 LSM4-201ENST00000252816 986 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 TFPT-201ENST00000391757 774 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 TFPT-202ENST00000391758 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 TSPY9P-201ENST00000440215 945 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 TSPY11P-201ENST00000442607 1045 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
ERVK11-1P61568 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK11-1P61568 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK11-1P61568 TST-201ENST00000249042 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK11-1P61568 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK11-1P61568 NAXE-202ENST00000368234 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK11-1P61568 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK11-1P61568 AP001267.3-203ENST00000554407 579 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK11-1P61568 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK11-1P61568 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
ERVK11-1P61568 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK11-1P61568 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK11-1P61568 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK11-1P61568 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK11-1P61568 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK11-1P61568 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
ERVK11-1P61568 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.5 ms