Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 DNAJB11-201ENST00000265028 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 CDIPT-207ENST00000566113 1671 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 ARHGEF9-210ENST00000623517 2143 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ERVFC1P60507 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 SNCB-201ENST00000310112 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 RBFOX1-206ENST00000535565 1599 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 ZNF174-202ENST00000344823 1557 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 SYNGR3-201ENST00000248121 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 AC105219.1-201ENST00000531565 1963 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 CCDC85B-201ENST00000312579 1524 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 FPGS-221ENST00000630236 2160 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 DGCR6-208ENST00000608842 1837 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 LTBP3-212ENST00000529189 1997 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ERVFC1P60507 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ERVFC1P60507 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.4 ms