Protein–RNA interactions for Protein: P60228

EIF3E, Eukaryotic translation initiation factor 3 subunit E, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EIF3EP60228 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 SLC30A2-201ENST00000374276 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
EIF3EP60228 CRTAC1-202ENST00000370591 2348 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 APBB3-204ENST00000358580 2020 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 BOD1-202ENST00000311086 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 ST20-MTHFS-201ENST00000479961 859 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 RNF4-207ENST00000506706 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 PPP4C-214ENST00000627746 1301 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 NAPRT-204ENST00000449291 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 CDR2-201ENST00000268383 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 DUSP22-214ENST00000605315 867 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 PDS5A-202ENST00000503396 2685 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 STK32C-201ENST00000298630 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 UBE2S-201ENST00000264552 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 AFDN-AS1-201ENST00000359760 2238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
EIF3EP60228 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 HTATSF1-201ENST00000218364 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 AC021242.3-201ENST00000607598 1377 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 MAPKAPK5-AS1-201ENST00000428207 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 TMEM147-203ENST00000392205 767 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 CLTA-204ENST00000433436 1235 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 BX664725.1-201ENST00000438252 379 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 CLTA-209ENST00000538225 1181 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 CLTA-210ENST00000540080 989 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 UBFD1-208ENST00000567264 642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 HACD1-202ENST00000361271 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
EIF3EP60228 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms