Protein–RNA interactions for Protein: P60174

TPI1, Triosephosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 286 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPI1P60174 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPI1P60174 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPI1P60174 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
TPI1P60174 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPI1P60174 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPI1P60174 CASK-201ENST00000378154 2494 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPI1P60174 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPI1P60174 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPI1P60174 TNFRSF10B-202ENST00000347739 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
TPI1P60174 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPI1P60174 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
TPI1P60174 HAR1A-201ENST00000433161 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPI1P60174 CBWD1-203ENST00000377400 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPI1P60174 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPI1P60174 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPI1P60174 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
TPI1P60174 CCDC151-203ENST00000591179 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPI1P60174 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPI1P60174 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPI1P60174 PCYT2-201ENST00000331285 2147 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPI1P60174 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPI1P60174 LDB1-201ENST00000361198 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPI1P60174 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TPI1P60174 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPI1P60174 DUSP8P5-201ENST00000422884 1815 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
TPI1P60174 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPI1P60174 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPI1P60174 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
TPI1P60174 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
TPI1P60174 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPI1P60174 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPI1P60174 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPI1P60174 MOSPD3-204ENST00000424091 1115 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPI1P60174 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPI1P60174 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPI1P60174 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPI1P60174 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPI1P60174 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPI1P60174 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPI1P60174 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPI1P60174 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPI1P60174 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
TPI1P60174 DIXDC1-205ENST00000529225 1945 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPI1P60174 IRX5-201ENST00000320990 2061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPI1P60174 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPI1P60174 HOXA10-206ENST00000613671 2175 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPI1P60174 AMZ2-202ENST00000359904 2402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPI1P60174 TTC9-201ENST00000256367 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPI1P60174 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
TPI1P60174 CA9-204ENST00000617161 1374 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPI1P60174 GPR161-203ENST00000367836 1983 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPI1P60174 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPI1P60174 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPI1P60174 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
TPI1P60174 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPI1P60174 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
TPI1P60174 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPI1P60174 PFKFB4-202ENST00000383734 1491 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPI1P60174 NAA30-202ENST00000554703 795 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPI1P60174 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPI1P60174 KCNS1-202ENST00000537075 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPI1P60174 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
TPI1P60174 ROGDI-201ENST00000322048 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPI1P60174 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPI1P60174 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPI1P60174 IQCJ-SCHIP1-201ENST00000412423 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPI1P60174 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPI1P60174 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPI1P60174 SPAG7-205ENST00000573366 1668 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPI1P60174 DLL3-201ENST00000205143 2332 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPI1P60174 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
TPI1P60174 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPI1P60174 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPI1P60174 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPI1P60174 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPI1P60174 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPI1P60174 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPI1P60174 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPI1P60174 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPI1P60174 CNPY3-201ENST00000372836 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPI1P60174 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPI1P60174 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPI1P60174 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPI1P60174 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
TPI1P60174 GMPPB-202ENST00000308388 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
TPI1P60174 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPI1P60174 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPI1P60174 USP36-218ENST00000590546 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
TPI1P60174 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPI1P60174 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPI1P60174 CPNE2-202ENST00000535318 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPI1P60174 ADD1-202ENST00000355842 4743 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPI1P60174 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPI1P60174 ZNRF1-205ENST00000566250 1069 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPI1P60174 ZNRF1-206ENST00000567962 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPI1P60174 NKILA-201ENST00000613231 537 ntTSL 4 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPI1P60174 IKZF1-207ENST00000413698 1808 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPI1P60174 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPI1P60174 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
TPI1P60174 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36 ms