Protein–RNA interactions for Protein: P59046

NLRP12, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,061 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP12P59046 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP12P59046 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP12P59046 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP12P59046 GCA-201ENST00000233612 1694 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP12P59046 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP12P59046 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP12P59046 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP12P59046 AC103724.3-201ENST00000564481 992 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP12P59046 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP12P59046 TRIR-205ENST00000592273 783 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP12P59046 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP12P59046 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NLRP12P59046 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 ASB6-201ENST00000277458 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 LINC00565-201ENST00000562710 2331 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 ZNF354A-201ENST00000335815 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 NRSN1-204ENST00000378491 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 YY1AP1-212ENST00000404643 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 KLHDC9-203ENST00000392192 1333 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 SDHAF1-201ENST00000378887 1117 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 TSPAN10-204ENST00000611590 1068 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 COMT-203ENST00000403184 2217 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 FAIM-201ENST00000338446 1622 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 HSPE1-201ENST00000233893 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 RAET1E-AS1-203ENST00000606915 1210 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 LSR-203ENST00000360798 1963 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 KCNQ5-213ENST00000629977 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 AL121906.1-201ENST00000606866 440 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 AL031848.2-201ENST00000607670 837 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 AC064853.4-201ENST00000641394 363 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 CPE-201ENST00000402744 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NLRP12P59046 IGFBP3-202ENST00000381083 1050 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 SKIDA1-201ENST00000444772 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 IDI1-201ENST00000381344 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 C6orf136-201ENST00000293604 1978 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 TMPO-AS1-201ENST00000546421 738 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 LIMS2-202ENST00000355119 2045 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 NFIX-203ENST00000397661 3143 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 FAM72A-202ENST00000367128 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 FAM72D-201ENST00000400889 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 EPS8L1-202ENST00000245618 2198 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NLRP12P59046 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20 ms